Protein–RNA interactions for Protein: Q5STT6

Fam71b, Protein FAM71B, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71bQ5STT6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fam71bQ5STT6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fam71bQ5STT6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fam71bQ5STT6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms