Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TefmQ5SSK3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TefmQ5SSK3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TefmQ5SSK3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms