Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSF7

Fam46c, Putative nucleotidyltransferase FAM46C, mousemouse

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Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam46cQ5SSF7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam46cQ5SSF7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam46cQ5SSF7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam46cQ5SSF7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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