Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vmn1r223Q5SSA0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vmn1r223Q5SSA0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms