Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rnf215Q5SPX3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rnf215Q5SPX3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rnf215Q5SPX3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms