Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttf2Q5NC05 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ttf2Q5NC05 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttf2Q5NC05 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttf2Q5NC05 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms