Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ5

Fam189b, Protein FAM189B, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam189bQ5HZJ5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fam189bQ5HZJ5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Fam189bQ5HZJ5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Fam189bQ5HZJ5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms