Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnni3kQ5GIG6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnni3kQ5GIG6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnni3kQ5GIG6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnni3kQ5GIG6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnni3kQ5GIG6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnni3kQ5GIG6 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnni3kQ5GIG6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnni3kQ5GIG6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnni3kQ5GIG6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnni3kQ5GIG6 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnni3kQ5GIG6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms