Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBH1

Rassf5, Ras association domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf5Q5EBH1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Rassf5Q5EBH1 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Rassf5Q5EBH1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rassf5Q5EBH1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms