Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrig2Q52KR2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Lrig2Q52KR2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lrig2Q52KR2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lrig2Q52KR2 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms