Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Snx25Q3ZT31 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx25Q3ZT31 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx25Q3ZT31 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms