Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Clul1Q3ZRW6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Clul1Q3ZRW6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clul1Q3ZRW6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clul1Q3ZRW6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clul1Q3ZRW6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Clul1Q3ZRW6 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clul1Q3ZRW6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clul1Q3ZRW6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Clul1Q3ZRW6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms