Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3T2

9130213A22Rik, RIKEN cDNA 9130213A22 gene, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9130213A22RikQ3V3T2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
9130213A22RikQ3V3T2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
9130213A22RikQ3V3T2 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms