Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Samd5Q3V1H9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Samd5Q3V1H9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Samd5Q3V1H9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms