Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q7

Tmprss12, Transmembrane protease serine 12, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmprss12Q3V0Q7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmprss12Q3V0Q7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tmprss12Q3V0Q7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmprss12Q3V0Q7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms