Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc43Q3V0L5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Lrrc43Q3V0L5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lrrc43Q3V0L5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
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