Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Garnl3Q3V0G7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Garnl3Q3V0G7 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Garnl3Q3V0G7 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms