Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
4933416C03RikQ3V063 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
4933416C03RikQ3V063 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
4933416C03RikQ3V063 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms