Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
E330034G19RikQ3UWX6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
E330034G19RikQ3UWX6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms