Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pfdn4Q3UWL8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pfdn4Q3UWL8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms