Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ScimpQ3UU41 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ScimpQ3UU41 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms