Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Shisa3Q3UPR0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa3Q3UPR0 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms