Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH1

Prrc1, Protein PRRC1, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc1Q3UPH1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Prrc1Q3UPH1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Prrc1Q3UPH1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Prrc1Q3UPH1 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms