Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem253Q3UNB8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tmem253Q3UNB8 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem253Q3UNB8 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms