Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Washc4Q3UMB9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Washc4Q3UMB9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Washc4Q3UMB9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Washc4Q3UMB9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms