Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ81

Cnep1r1, Nuclear envelope phosphatase-regulatory subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnep1r1Q3UJ81 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cnep1r1Q3UJ81 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cnep1r1Q3UJ81 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms