Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGF1

Wdr19, WD repeat-containing protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr19Q3UGF1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Wdr19Q3UGF1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Wdr19Q3UGF1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Wdr19Q3UGF1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms