Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsph3aQ3UFY4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rsph3aQ3UFY4 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rsph3aQ3UFY4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms