Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nom1Q3UFM5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Nom1Q3UFM5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nom1Q3UFM5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms