Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9F6

Rnf166, RING finger protein 166, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf166Q3U9F6 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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Rnf166Q3U9F6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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Rnf166Q3U9F6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rnf166Q3U9F6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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Rnf166Q3U9F6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rnf166Q3U9F6 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rnf166Q3U9F6 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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Rnf166Q3U9F6 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rnf166Q3U9F6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Rnf166Q3U9F6 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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Rnf166Q3U9F6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rnf166Q3U9F6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Rnf166Q3U9F6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rnf166Q3U9F6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms