Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Q3U6N9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3U6N9 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Q3U6N9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U6N9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3U6N9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Q3U6N9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Q3U6N9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3U6N9 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Q3U6N9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms