Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Kdm4dQ3U2K5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Kdm4dQ3U2K5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Kdm4dQ3U2K5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms