Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Palb2Q3U0P1 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Palb2Q3U0P1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Palb2Q3U0P1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms