Protein–RNA interactions for Protein: Q3TXX4

Slc17a7, Vesicular glutamate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc17a7Q3TXX4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc17a7Q3TXX4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Slc17a7Q3TXX4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Slc17a7Q3TXX4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms