Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTY5

Krt2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt2Q3TTY5 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt2Q3TTY5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt2Q3TTY5 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt2Q3TTY5 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms