Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Q3TTJ4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Q3TTJ4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Q3TTJ4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms