Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ctdnep1Q3TP92 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctdnep1Q3TP92 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctdnep1Q3TP92 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms