Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gtf3c3Q3TMP1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gtf3c3Q3TMP1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gtf3c3Q3TMP1 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms