Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Nlrp4cQ3TKR3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp4cQ3TKR3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp4cQ3TKR3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp4cQ3TKR3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms