Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDQ1

Stt3b, Dolichyl-diphosphooligosaccharide--protein glycosyltransferase subunit STT3B, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stt3bQ3TDQ1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stt3bQ3TDQ1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stt3bQ3TDQ1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stt3bQ3TDQ1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stt3bQ3TDQ1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stt3bQ3TDQ1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stt3bQ3TDQ1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Stt3bQ3TDQ1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Stt3bQ3TDQ1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Stt3bQ3TDQ1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Stt3bQ3TDQ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Stt3bQ3TDQ1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms