Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDD9

Ppp1r21, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 21, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r21Q3TDD9 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ppp1r21Q3TDD9 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ppp1r21Q3TDD9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ppp1r21Q3TDD9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms