Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cul4aQ3TCH7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cul4aQ3TCH7 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cul4aQ3TCH7 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms