Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tmem248Q3TBN1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem248Q3TBN1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem248Q3TBN1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms