Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Riiad1Q3KNY5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Riiad1Q3KNY5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Riiad1Q3KNY5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms