Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdgfl1Q2VPR5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdgfl1Q2VPR5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms