Protein–RNA interactions for Protein: Q2MKA5

Chrna5, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna5Q2MKA5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Chrna5Q2MKA5 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Chrna5Q2MKA5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chrna5Q2MKA5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chrna5Q2MKA5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms