Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2N2

Spopl, Speckle-type POZ protein-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpoplQ2M2N2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SpoplQ2M2N2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SpoplQ2M2N2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SpoplQ2M2N2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms