Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm1123Q1RME4 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm1123Q1RME4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm1123Q1RME4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm1123Q1RME4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm1123Q1RME4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm1123Q1RME4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms