Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim71Q1PSW8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim71Q1PSW8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim71Q1PSW8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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