Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpusd3Q14AI6 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpusd3Q14AI6 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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